MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides J18 plasmid pKLE04

Total Repeats: 435

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_016828	GTT	2	6	16	21	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2	NC_016828	CCA	2	6	29	34	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3	NC_016828	TGC	2	6	76	81	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_016828	CCA	2	6	101	106	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5	NC_016828	ACT	2	6	122	127	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_016828	CAT	2	6	129	134	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_016828	TTA	2	6	165	170	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_016828	GTC	2	6	171	176	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_016828	CTT	2	6	218	223	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_016828	AAT	2	6	231	236	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_016828	TA	3	6	247	252	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_016828	TTA	2	6	290	295	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_016828	A	6	6	349	354	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_016828	CTT	2	6	355	360	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_016828	ATT	2	6	362	367	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379987606
16	NC_016828	CTT	3	9	395	403	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379987606
17	NC_016828	TCA	2	6	511	516	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379987606
18	NC_016828	TGA	2	6	527	532	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379987606
19	NC_016828	AAG	2	6	602	607	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379987606
20	NC_016828	AT	3	6	622	627	50 %	50 %	0 %	0 %	379987606
21	NC_016828	TTC	2	6	634	639	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379987606
22	NC_016828	T	6	6	642	647	0 %	100 %	0 %	0 %	379987606
23	NC_016828	T	6	6	657	662	0 %	100 %	0 %	0 %	379987606
24	NC_016828	GTT	2	6	677	682	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	379987606
25	NC_016828	ACT	2	6	774	779	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379987607
26	NC_016828	T	6	6	788	793	0 %	100 %	0 %	0 %	379987607
27	NC_016828	GTT	2	6	901	906	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	379987607
28	NC_016828	AAT	2	6	908	913	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379987607
29	NC_016828	GGA	2	6	933	938	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	379987607
30	NC_016828	TTTC	2	8	982	989	0 %	75 %	0 %	25 %	379987607
31	NC_016828	GTT	2	6	1057	1062	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	379987608
32	NC_016828	TGAT	2	8	1068	1075	25 %	50 %	25 %	0 %	379987608
33	NC_016828	T	6	6	1091	1096	0 %	100 %	0 %	0 %	379987608
34	NC_016828	TTC	2	6	1103	1108	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379987608
35	NC_016828	GCA	2	6	1115	1120	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379987608
36	NC_016828	T	7	7	1152	1158	0 %	100 %	0 %	0 %	379987608
37	NC_016828	TTAT	2	8	1228	1235	25 %	75 %	0 %	0 %	379987608
38	NC_016828	ATT	2	6	1269	1274	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379987608
39	NC_016828	ATTA	2	8	1281	1288	50 %	50 %	0 %	0 %	379987608
40	NC_016828	TAG	2	6	1307	1312	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379987608
41	NC_016828	TAA	2	6	1363	1368	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_016828	TTATT	2	10	1450	1459	20 %	80 %	0 %	0 %	379987609
43	NC_016828	AACT	2	8	1483	1490	50 %	25 %	0 %	25 %	379987609
44	NC_016828	TTTA	2	8	1505	1512	25 %	75 %	0 %	0 %	379987609
45	NC_016828	TG	3	6	1518	1523	0 %	50 %	50 %	0 %	379987609
46	NC_016828	AAT	2	6	1565	1570	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379987609
47	NC_016828	CTG	2	6	1648	1653	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379987609
48	NC_016828	TCA	2	6	1659	1664	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379987609
49	NC_016828	TTC	2	6	1700	1705	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379987609
50	NC_016828	GCTT	2	8	1710	1717	0 %	50 %	25 %	25 %	379987609
51	NC_016828	ATA	2	6	1851	1856	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379987609
52	NC_016828	GTTTT	2	10	1870	1879	0 %	80 %	20 %	0 %	379987609
53	NC_016828	TCG	2	6	2003	2008	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379987609
54	NC_016828	TTC	2	6	2042	2047	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379987609
55	NC_016828	TTC	2	6	2088	2093	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
56	NC_016828	TTG	2	6	2111	2116	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
57	NC_016828	TGAAAT	2	12	2138	2149	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
58	NC_016828	ATT	2	6	2155	2160	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_016828	TAA	2	6	2164	2169	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_016828	TAT	2	6	2225	2230	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379987610
61	NC_016828	AATT	2	8	2260	2267	50 %	50 %	0 %	0 %	379987610
62	NC_016828	TACT	2	8	2280	2287	25 %	50 %	0 %	25 %	379987610
63	NC_016828	TAA	2	6	2289	2294	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379987610
64	NC_016828	ATA	2	6	2298	2303	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379987610
65	NC_016828	AT	3	6	2315	2320	50 %	50 %	0 %	0 %	379987610
66	NC_016828	ATC	2	6	2347	2352	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379987610
67	NC_016828	T	6	6	2365	2370	0 %	100 %	0 %	0 %	379987610
68	NC_016828	AAT	2	6	2395	2400	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379987610
69	NC_016828	GAC	2	6	2415	2420	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379987610
70	NC_016828	TCT	2	6	2520	2525	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379987610
71	NC_016828	TTCAAC	2	12	2551	2562	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379987610
72	NC_016828	T	6	6	2642	2647	0 %	100 %	0 %	0 %	379987610
73	NC_016828	CAA	2	6	2752	2757	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	379987610
74	NC_016828	T	6	6	2818	2823	0 %	100 %	0 %	0 %	379987610
75	NC_016828	CT	3	6	2890	2895	0 %	50 %	0 %	50 %	379987610
76	NC_016828	AAT	2	6	2920	2925	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379987610
77	NC_016828	ATA	2	6	2983	2988	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379987610
78	NC_016828	T	7	7	2995	3001	0 %	100 %	0 %	0 %	379987610
79	NC_016828	CGGT	2	8	3007	3014	0 %	25 %	50 %	25 %	379987610
80	NC_016828	ATT	2	6	3020	3025	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379987610
81	NC_016828	TCA	2	6	3038	3043	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379987610
82	NC_016828	TCA	2	6	3128	3133	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379987610
83	NC_016828	TATT	2	8	3167	3174	25 %	75 %	0 %	0 %	379987610
84	NC_016828	T	6	6	3194	3199	0 %	100 %	0 %	0 %	379987610
85	NC_016828	ACC	2	6	3221	3226	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	379987610
86	NC_016828	ATT	2	6	3331	3336	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379987610
87	NC_016828	ATC	2	6	3406	3411	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379987610
88	NC_016828	AAATGG	2	12	3477	3488	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	379987610
89	NC_016828	GAT	2	6	3588	3593	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379987610
90	NC_016828	AAT	2	6	3605	3610	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379987610
91	NC_016828	GTT	2	6	3629	3634	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	379987610
92	NC_016828	AATG	2	8	3643	3650	50 %	25 %	25 %	0 %	379987610
93	NC_016828	TTTA	2	8	3787	3794	25 %	75 %	0 %	0 %	379987610
94	NC_016828	ATC	2	6	3820	3825	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379987610
95	NC_016828	GGA	2	6	3854	3859	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	379987610
96	NC_016828	AAT	2	6	3865	3870	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379987610
97	NC_016828	CTT	2	6	3885	3890	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379987610
98	NC_016828	CGT	2	6	3909	3914	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379987610
99	NC_016828	ATC	3	9	3928	3936	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379987610
100	NC_016828	ATTT	2	8	4018	4025	25 %	75 %	0 %	0 %	379987610
101	NC_016828	AACAA	2	10	4070	4079	80 %	0 %	0 %	20 %	379987610
102	NC_016828	CGTACC	2	12	4186	4197	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	379987610
103	NC_016828	CAT	2	6	4263	4268	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379987610
104	NC_016828	GAA	2	6	4354	4359	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379987610
105	NC_016828	GAT	2	6	4378	4383	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379987610
106	NC_016828	TCT	2	6	4394	4399	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379987610
107	NC_016828	TCA	2	6	4616	4621	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379987610
108	NC_016828	TGA	2	6	4648	4653	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379987610
109	NC_016828	T	6	6	4660	4665	0 %	100 %	0 %	0 %	379987610
110	NC_016828	TCAT	2	8	4892	4899	25 %	50 %	0 %	25 %	379987610
111	NC_016828	GTT	2	6	4935	4940	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	379987610
112	NC_016828	ATCA	2	8	4963	4970	50 %	25 %	0 %	25 %	379987610
113	NC_016828	AACGC	2	10	4995	5004	40 %	0 %	20 %	40 %	379987610
114	NC_016828	ATTA	2	8	5005	5012	50 %	50 %	0 %	0 %	379987610
115	NC_016828	TTA	2	6	5039	5044	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379987610
116	NC_016828	ATA	2	6	5093	5098	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379987610
117	NC_016828	ATA	2	6	5129	5134	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379987610
118	NC_016828	T	6	6	5167	5172	0 %	100 %	0 %	0 %	379987610
119	NC_016828	AAG	2	6	5225	5230	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379987610
120	NC_016828	CTG	2	6	5259	5264	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379987610
121	NC_016828	TCA	2	6	5360	5365	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379987610
122	NC_016828	AAC	2	6	5389	5394	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	379987610
123	NC_016828	TTC	2	6	5395	5400	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379987610
124	NC_016828	GCTC	2	8	5453	5460	0 %	25 %	25 %	50 %	379987610
125	NC_016828	CAT	2	6	5472	5477	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379987610
126	NC_016828	ACG	2	6	5512	5517	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379987610
127	NC_016828	CAT	2	6	5518	5523	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379987610
128	NC_016828	CAT	2	6	5553	5558	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379987610
129	NC_016828	TACT	2	8	5711	5718	25 %	50 %	0 %	25 %	379987610
130	NC_016828	AGA	2	6	5731	5736	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379987610
131	NC_016828	T	6	6	5748	5753	0 %	100 %	0 %	0 %	379987610
132	NC_016828	CTT	2	6	5865	5870	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379987610
133	NC_016828	TAG	2	6	5871	5876	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379987610
134	NC_016828	TCA	2	6	5906	5911	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379987610
135	NC_016828	GAT	2	6	5914	5919	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379987610
136	NC_016828	T	7	7	5942	5948	0 %	100 %	0 %	0 %	379987610
137	NC_016828	GTA	2	6	6039	6044	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379987610
138	NC_016828	T	6	6	6045	6050	0 %	100 %	0 %	0 %	379987610
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405	NC_016828	TAT	2	6	17769	17774	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379987621
406	NC_016828	TCC	2	6	17822	17827	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	379987622
407	NC_016828	TCT	3	9	17834	17842	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379987622
408	NC_016828	CAC	2	6	17886	17891	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	379987622
409	NC_016828	TTA	2	6	17903	17908	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379987622
410	NC_016828	A	7	7	17917	17923	100 %	0 %	0 %	0 %	379987622
411	NC_016828	GCA	2	6	17927	17932	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379987622
412	NC_016828	TTG	2	6	17944	17949	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	379987622
413	NC_016828	TGA	2	6	17978	17983	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379987622
414	NC_016828	CAT	2	6	18057	18062	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379987622
415	NC_016828	TAA	2	6	18159	18164	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379987622
416	NC_016828	TAC	2	6	18193	18198	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379987622
417	NC_016828	AGTGA	2	10	18295	18304	40 %	20 %	40 %	0 %	379987622
418	NC_016828	GCAA	2	8	18442	18449	50 %	0 %	25 %	25 %	379987622
419	NC_016828	CT	3	6	18487	18492	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
420	NC_016828	ACC	2	6	18559	18564	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
421	NC_016828	TTG	2	6	18636	18641	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
422	NC_016828	GTTA	2	8	18655	18662	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
423	NC_016828	ATT	2	6	18694	18699	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
424	NC_016828	ATC	2	6	18763	18768	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
425	NC_016828	TCA	2	6	18812	18817	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
426	NC_016828	ATCT	2	8	18853	18860	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
427	NC_016828	CGA	2	6	18914	18919	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
428	NC_016828	CAC	2	6	18981	18986	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
429	NC_016828	AAAG	2	8	19015	19022	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
430	NC_016828	TTC	2	6	19069	19074	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
431	NC_016828	ATT	2	6	19096	19101	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
432	NC_016828	AAT	2	6	19114	19119	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
433	NC_016828	CTA	2	6	19131	19136	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
434	NC_016828	ATC	2	6	19174	19179	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
435	NC_016828	TTG	2	6	19272	19277	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.